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理学部
数学科には、代数数理、幾何学、解析学、確率統計とそれらの応用など、現代数理科学の各分野を研究する11の研究グループがある。講義のほとんどは演習と並行して行われる。
物理科学科には、素粒子物理学、宇宙科学、物性物理学、放射光科学などを研究する18の研究グループがある。物理数学、力学、天文学、熱統計力学、電磁気学、量子力学などの専門基礎科目、相対性理論、固体物理学などの専門科目の講義、関連する演習・実験やコンピュータ実習が行われている。
化学科では、無機・分析化学、物理化学、有機化学、生命化学など、幅広い分野にわたる14の研究グループで専門的教育とハイレベルな研究を行っている。
生物科学科では、分子から個体・集団レベルに至る多様な視点から、12の研究グループが生命の謎の解明にいどんでいる。講義・実習・演習では、分類学、細胞生物学、生理学、生化学、分子生物学など基礎生物学の諸分野を幅広くカバーし、ゲノム、再生、組み替え植物など最先端の研究成果も反映させた授業科目を編成している。豊かな自然に恵まれたふたつの附属実験所での実習も特色である。
地球惑星システム学科は、3つの教育研究グループで、太陽系・地球・日本列島の誕生と進化、地震・断層・地すべり・マントル対流など地球上のダイナミックな変動現象、人類が直面している地球環境問題および資源問題など、地球惑星科学の基礎から最先端分野までを網羅した教育と研究を行っている。講義・演習・実験に加えて、野外調査を行うことが特色である。